病理诊断中心于2014年开始筹建，2015年12月6日正式成立，并对外开展业务，已托管了树兰（杭州）医院病理科及绍兴袍江医院病理科等多家单位。病理诊断中心按照国际JCI标准、美国病理学家协会CAP及CNAS 15189质量管理体系建设，经过体系相关内容宣贯、动员科室全员参与、编写体系文件、体系正式运行、内部审核、管理评审、外部审核等步骤，建立一套能持续改进、流程自我完善的质量管理体系，最终实现与集团质量管理体系的全面并轨。

开展的特色项目有术中冰冻、基因检测、网络会诊、肝移植评估、肝肾穿刺、骨髓活检等

病理诊断中心与加拿大安大略省荷顿总医院病理系、多伦多大学医学院西奈山医院病理科、浙江大学附属第一医院病理科、邵逸夫医院病理科、浙江省人民医院病理科等均建立了良好的联系，通过共同医学研究和临床医疗确立长期合作关系，并组建完成远程病理诊断平台及组织样本库。同时病理诊断部将不断加强人才队伍建设和高层次人才引进工作，致力于建设成区域内乃至全国闻名的综合性病理诊断中心。利用树兰医疗集团科研平台和资源，为科室科研课题设计、论文发表等提供协助，共同举办学术会议等，提升医院的科研及学术水平，打造一个具备行业标准、产、教、研一体，区域内有一定影响力的病理实验室。与国内相关病理组织机构建立长期战略合作关系等国内外资源帮助院方引进相应的专家顾问，并为病理科人员提供国内的学习与交流培训机会，全面完善提升院方病理人才梯队建设及技术水平，使病理科的诊断科研教学达到地区先进水平。